La regulación de la Unión Europea establece una serie de principios básicos en la producción ecológica. Tanto los procesos de cultivo como de cría tipo bio deben utilizar los recursos naturales propios del sistema, restringiendo los insumos externos, limitando lo máximo posible el uso de químicos sintéticos y prohibiendo los organismos modificados genéticamente (OMG).

El reglamento en el que se apoya la producción del sector bio es bastante amplio, pero puede resumirse en una serie de elementos esenciales por cada una de las áreas de producción:

• En el ámbito de la agricultura, las prácticas de cultivo solo se consideran ecológicas si mantienen la fertilidad natural y previenen la erosión del suelo. Estas prácticas deben reducir el uso de los recursos no renovables, utilizar insumos de origen ecológico en exclusividad y conservar la salud de las plantas. La agricultura bio garantiza la rotación de los cultivos y rechaza el empleo de fertilizantes minerales nitrogenados.
• En cuanto a la cría ecológica, los animales deben poder estar en grandes extensiones al aire libre con baja densidad, para combatir el pastoreo excesivo. Se debe priorizar la salud de los animales mediante los medios naturales de defensa y ningún animal puede ser atado ni aislado del resto. La alimentación de estos animales debe proceder de la agricultura bio y otras sustancias naturales. Para su reproducción, los ganaderos deben utilizar métodos naturales, permitiéndose la inseminación artificial, pero no la clonación, la transferencia de embriones ni el tratamiento a base de hormonas.

• La Comisión Europea establece una lista de compuestos que pueden utilizarse en la elaboración de los productos bio, los cuales respetan determinados criterios y responden a necesidades específicas.